L'assèchement de la mer d'Aral pose de graves problèmes environnementaux, sanitaires, sociaux et politiques, ça on le sait. Mais apparement il semblerait que ce ne soit pas la première fois que cela se produise :

"... le véritable évènement est récemment venu des scientifiques et notamment des archéologues qui ont démontré que ce recul des eaux s’était déjà produit quatre fois au cours de l’histoire de cette mer jusqu’à atteindre un assèchement presque complet. Or, le niveau est à chaque fois remonté. On a ainsi trouvé des traces de culture du blé, du mil et de légumes mais aussi les vestiges de villes antiques dans ce qui est le fond de la mer contemporaine ..."

http://www.regarddegeographe.com/article-a-propos-de-la-mer-d-aral-d-etonnantes-informations-47356966.html

Il y a de nombreuses théories sur le sujet.

L'hypothèse géologique/tectonique est rendue crédible par l'observation de l'assèchement d'un lac américain dans le parc de Yellowstone suite a de petits mouvements tectoniques: les sédiments ont cédé, découvrant une faille et faisant communiquer le lac avec un de ses voisins, d'altitude inférieure.

Cela ne dédouane cependant pas l'irrigation soviétique pour la culture du coton, que celle ci soit la cause principale de l'assèchement ou un facteur aggravant.

Complètement d'accord.

Déterminisme naturel contre déterminisme agronomique: is it the question?

J'ai lu récemment (mais où ?) qu'il y a un léger mieux : la Mer d'Aral est constituée de la "petite mer" au nord (10 à 12% de la superficie) et de la "grande mer" au sud. Par la construction de digues entre les deux, le niveau des eaux de la petite mer est presque revenu à la normale. Reste évidemment la grande mer... Un remède serait un canal entre la mer Caspienne et Aral. Mais outre le coût, il faut noter que le niveau de la Caspienne a lui aussi baissé depuis ne serait-ce que depuis les années 1950 (il suffit de regarder les cartes).
On pourrait aussi détourner des fleuves sibériens, dont l'eau, actuellement, va se perdre dans l'océan Arctique. Là aussi, c'est très coûteux...